| Siracusa | P. 05:06 | 2 |
| Augusta | 05.24 05:25 | 2 |
| Lentini | 05.46 05:47 | 1 |
| Catania Aeroporto - Fontanarossa | 06.02 06:04 | 2 |
| Catania Centrale | 06.12 06:17 | 2 |
| Acireale | 06.29 06:30 | 2 |
| Giarre Riposto | 06.39 06:40 | 2 |
| Fiumefreddo Di Sicilia | 06.50 06:51 | 1 |
| Alcantara | 06.56 06:57 | 3 |
| Taormina | 07.00 07:01 | 1 |
| Santa Teresa Di Riva | 07.12 07:13 | 1 |
| Messina Centrale | 07.51 A. | 8 |
Il treno 5396 parte alle ore 05:06, generalmente dal binario 2
Il treno 5396 arriva alle ore 07:51, generalmente al binario 8
La durata prevista del viaggio è di 2 ore e 45 minuti
Il treno 5396 effettua servizio di trasporto bici al seguito.