| Venezia S.lucia | P. 05:40 | 18 |
| Venezia Mestre | 05.53 05:53 | 10 |
| Padova | 06.12 06:12 | 1 |
| Terme Euganee-abano-montegrotto | 06.21 06:21 | 3 |
| Monselice | 06.30 06:30 | 1 |
| Rovigo | 06.48 06:48 | 2 |
| Ferrara | 07.05 07:05 | 3 |
| S.pietro In Casale | 07.18 07:18 | 2 |
| Bologna Centrale | 07.45 A. | 11 |
Il treno 3961 parte alle ore 05:40, generalmente dal binario 18
Il treno 3961 arriva alle ore 07:45, generalmente al binario 11
La durata prevista del viaggio è di 2 ore e 5 minuti
Il treno 3961 effettua servizio di trasporto bici al seguito.
Il treno 3961 presenta una carrozza attrezzata per il trasporto di passeggeri su sedia a rotelle